DNA测序仪
DNA测序仪用途:
DNA测序仪用于亲子鉴定、个体识别、基因档案、父系鉴定、母系鉴定、种族鉴定、种属鉴定等。
DNA测序仪测序原理:
在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得DNA序列。目前Sanger测序法得到了广泛的应用。
Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。
基本测序过程:
测序接收的样品主要有四类:菌、质粒、已纯化PCR和PCR原液。
1、测序前处理:
(1)菌样:将当天收取的菌样进行接种培养,过夜培养后用试剂盒进行质粒提取。将提出的质粒跑琼脂糖胶鉴定质粒浓度,达到规定浓度的质粒交下一组实验,未达到规定浓度的质粒和未摇出菌的样品,作好记录后重新摇菌并提取质粒,对于两次未能提出质粒或不能摇出菌的样品,不再重复实验,E-MAIL给客户,建议客户重新挑取新的克隆样品后测序。
(2)PCR原液:将PCR原液上样于纯化胶后电泳检测,对浓度较高的样品进行切胶用胶回收试剂盒回收,去除PCR引物、酶和其他杂质。然后电泳检测样品浓度,达到规定浓度的PCR样品交下一组实验。浓度不高的样品将停止实验,(注:电泳后有多条带和有弥散带的样品也将停止实验,因为这样的样品通常不能得到好的测序结果)。
(3)质粒和PCR已纯化样品:将.质粒和PCR已纯化样品直接电泳检测浓度,对于不能达到规定浓度的样品将停止实验。达到规定浓度的样品交下一组实验。
2、测序反应:
将处理好的DNA模板经鉴定确定浓度,根据特有的反应体系做PCR测序反应,PCR反应结束后经过一系列的纯化过程将酶、荧光染料、引物和其他离子去除。
3、上测序仪做毛细管电泳。
4、测序结果分析:
测序仪将自动分析电泳样品的DNA序列。
DNA测序仪用于亲子鉴定、个体识别、基因档案、父系鉴定、母系鉴定、种族鉴定、种属鉴定等。
DNA测序仪测序原理:
在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得DNA序列。目前Sanger测序法得到了广泛的应用。
Sanger法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。
基本测序过程:
测序接收的样品主要有四类:菌、质粒、已纯化PCR和PCR原液。
1、测序前处理:
(1)菌样:将当天收取的菌样进行接种培养,过夜培养后用试剂盒进行质粒提取。将提出的质粒跑琼脂糖胶鉴定质粒浓度,达到规定浓度的质粒交下一组实验,未达到规定浓度的质粒和未摇出菌的样品,作好记录后重新摇菌并提取质粒,对于两次未能提出质粒或不能摇出菌的样品,不再重复实验,E-MAIL给客户,建议客户重新挑取新的克隆样品后测序。
(2)PCR原液:将PCR原液上样于纯化胶后电泳检测,对浓度较高的样品进行切胶用胶回收试剂盒回收,去除PCR引物、酶和其他杂质。然后电泳检测样品浓度,达到规定浓度的PCR样品交下一组实验。浓度不高的样品将停止实验,(注:电泳后有多条带和有弥散带的样品也将停止实验,因为这样的样品通常不能得到好的测序结果)。
(3)质粒和PCR已纯化样品:将.质粒和PCR已纯化样品直接电泳检测浓度,对于不能达到规定浓度的样品将停止实验。达到规定浓度的样品交下一组实验。
2、测序反应:
将处理好的DNA模板经鉴定确定浓度,根据特有的反应体系做PCR测序反应,PCR反应结束后经过一系列的纯化过程将酶、荧光染料、引物和其他离子去除。
3、上测序仪做毛细管电泳。
4、测序结果分析:
测序仪将自动分析电泳样品的DNA序列。